Памятник венчают восемь глав, создающие живописное и сложное завершение. Пять из них, поставленные на цилиндрические барабаны, главенствуют над основным четвериком. Ещё три главы располагаются отдельно: одна — над приделом на восьмигранном барабане, вторая венчает колокольню, также на восьмигранном основании, и ещё одна, на цилиндрическом барабане, возвышается над выступающей частью подклета с восточной стороны. Все главы увенчаны сияющими позолоченными крестами на традиционных «яблоках». Особую нарядность придают детали: главы над четвериком и колокольней украшены позолоченными восьмиконечными звёздами, а пять глав основного объёма дополнены ажурными позолоченными резными подзорами.

Летом 2024 года специалисты Ярославской художественной мастерской «Реставратор» провели комплексные научные исследования и разработали проект реставрации глав церкви, направленный на сохранение их исторического вида.

Проект включает очистку и ремонт окрасочного слоя, антикоррозийную обработку кровельного покрытия и несущих каркасов, а также окраску глав и золочение сусальным золотом архитектурных элементов — звезд, крестов и подзоров.

В рамках проекта была выбрана методика полного перезолочения. Технология включает обязательный этап полной очистки поверхности (раскрытие до металла), гарантирующий безупречное сцепление и долговечность. Для нанесения применяется сусальное золото наивысшей пробы. Такое покрытие не только воссоздает исторический вид, но и обеспечивает защиту на десятилетия.